腐蝕性水中Cl-、游離CO2等都具腐蝕性，溶解氧的存在增加了對金屬管道的腐蝕破壞作用。應用水源熱泵系統時，對腐蝕性、硬度高的水源，應在系統中加裝抗腐蝕的不銹鋼換熱器或鈦板換熱器。　　
不銹鋼換熱器有些水源礦化度較高，對金屬的腐蝕性較強，如直接進入機組會因腐蝕作用減少機組使用壽命。如果通過水處理的辦法減少礦化度，費用很大。通常采用加裝板式換熱器中間換熱的方式，把水源水與機組隔開，使機組免了水源水可能產生的腐蝕作用。
當水源水的礦化度小于350mg/L時，水源系統可以不加換熱器，采用直供連接。當水源水礦化度為350-500mg/L時，可以安裝不銹鋼換熱器。當水源水礦化度＞500mg/L時，應安裝抗腐蝕性好的鈦合金板式換熱器。也可安裝容積式換熱器，費用比板式換熱器少。
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